臭氧是公认的最全面有效的杀菌剂，杀菌速度快，臭氧的消毒效率比氯高一倍,接触15分钟就能迅速地完成杀菌作用。细菌对臭氧最为敏感,病毒的抵抗力较强。胞囊与芽抱的单位致死系数要比病毒小10倍左右,抵抗力大10倍左右。因为臭氧对大肠菌、肠道致病菌、抗酸菌、结核菌、枯草芽胞、噬菌体、蛔虫卵等都有很强的杀灭作用,故臭氧可用于医院污水消毒。
国外为灭活病毒而推荐的表示污水消毒前预处理程度的参考指标(略)。 臭氧作为一种广谱杀菌剂,能比较广泛地杀灭细菌、藻类、病毒及饱子。较快地氧化有机物,有效地降低BOD、COD,因此臭氧在二级出水后续处理工艺上具有广泛的应用条件,是一个有前途的污水三级处理剂。
传统进行同样的消毒操作至少需要10分钟。在医院中最易引起感染的黄色葡萄球菌和绿脓杆菌等在臭氧水中只需5秒钟即可全部杀死，其杀菌力远远超过酒精和氯。而且臭氧水具有可靠的安全性，经常使用不会伤及肌肤，即使误喝也不会中毒。
臭氧还可以用于治疗。基本方法就是在高压下用雾状富含臭氧的生理溶液冲洗伤口，水流就象手术刀一样将伤口中的脓血、坏死组织及细菌分解物清除，同时杀死伤口表面的致病微生物。
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